Сам того не подозревая, трубопровод СЕГ подтолкнул экологов к мысли об очищении дна Балтийского моря от химического вооружения времен Второй Мировой войны. Экологи уверены, что трубопровод нужно строить только на чистом дне.
Международный Фонд экологической безопасности Балтийского моря призывают США и страны Европы повлиять на правительства, чтобы Балтика была очищена от химических захоронений Второй мировой войны.
Учредитель Фонда, Арнольд Порк, также подчеркнул необходимость строительства Северо-Европейского газопровода (СЕГ), но лишь после обезвреживания химических захоронений. Отметим, что СЕГ становится для многих стран все более приемлимым с наступлением холодов - все больше стран видят в нем экономику, а не политику.